ε- پلی لیزین پودری به رنگ زرد روشن با خاصیت رطوبت سنجی قوی و طعم کمی تلخ است. این یک پلیمر با زنجیره مستقیم از لیزین است. تحت تأثیر مقدار pH قرار نمی گیرد، از نظر حرارتی پایدار است (120 درجه، 20 دقیقه)، و می تواند باکتری های مقاوم در برابر حرارت را مهار کند، بنابراین پس از افزودن می توان آن را تحت عملیات حرارتی قرار داد. با این حال، هنگام مواجهه با پلی ساکاریدهای اسیدی، نمک های هیدروکلراید، فسفات ها، یون های مس و غیره، ممکن است فعالیت آنها به دلیل اتصال کاهش یابد. هنگامی که با اسید هیدروکلریک، اسید سیتریک، اسید مالیک، گلیسین و گلیسریدهای چرب بالاتر ترکیب شود، اثرات هم افزایی دارد. وزن مولکولی بین 3600-4300 ε- پلی لیزین بهترین فعالیت ضد باکتریایی را دارد و زمانی که وزن مولکولی آن زیر 1300 باشد ε- پلی لیزین فعالیت ضد باکتریایی خود را از دست می دهد. با توجه به این که پلی لیزین مخلوطی است، نقطه ذوب ثابتی ندارد و در بالای 250 درجه شروع به نرم شدن و تجزیه می کند. ε پلی لیزین در آب و کمی در اتانول محلول است. تجزیه و تحلیل طیف مادون قرمز مشخصه آن نشان می دهد که پیک های جذب قوی در 1680-1640سانتی متر{10}} و 1580-1520سانتی متر{12}} وجود دارد.